53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0928 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0928  cellobiose phosphotransferase system IIB component  100 
 
 		 105 aa  215  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1585  cellobiose phosphotransferase system IIB component  40 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0900  PTS system, cellobiose-specific IIB component  39.53 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03625  hypothetical protein  36.05 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1659  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  36.05 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0329869  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1633  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  34.48 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.640995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1739  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  34.48 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1620  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  34.48 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0607362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0704  PTS system, cellobiose-specific component IIB  36.36 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2290  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  29.7 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.4303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2253  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIB component  29.7 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2462  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  29.7 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2479  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  29.7 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2211  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIB component  29.7 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2495  PTS system, cellobiose-specific IIB component, putative  29.7 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2417  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  30 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2558  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  29.7 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1257  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.9 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2269  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.74 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.316995  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B06  chitibiose transporter protein chbB  33.78 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0008  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.88 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2913  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  29 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.609986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0028  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.07 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0009  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.88 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4224  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.57 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.211197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2134  PTS system, lactose/cellobiose family IIB subunit  36.49 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0685  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.05 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.07 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3348  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.72 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0200  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.23 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.572333  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1789  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.74 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0223  cellobiose-specific PTS system IIB component  28.24 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.981208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1208  cellobiose-specific PTS system IIB component  28.24 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.745209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0533  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.95 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0194  cellobiose-specific PTS system IIB component  29.41 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.173485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5007  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  32.43 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5326  PTS system, cellobiose-specific IIB component  32.43 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1855  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.91 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5383  PTS system, cellobiose-specific IIB component  31.08 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4909  PTS system, cellobiose-specific IIB subunit  31.08 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5623  PTS system, cellobiose-specific IIB component  31.08 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000565643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2602  PTS system, IIB component  29.89 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002435  PTS system cellobiose-specific IIB component  32.39 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0329  PTS system, cellobiose-specific IIB component  30.23 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0210204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3467  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.41 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5336  PTS system, cellobiose-specific IIB component  29.73 
 
 		 100 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5305  PTS system, cellobiose-specific IIB component  29.73 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000478718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5449  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  29.73 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4896  PTS system, cellobiose-specific IIB subunit  29.73 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5064  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  29.73 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.12 
 
 		 546 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2670  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.46 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1617  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  30.23 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>