59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1585 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1585  cellobiose phosphotransferase system IIB component  100 
 
 		 105 aa  217  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0928  cellobiose phosphotransferase system IIB component  40 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03625  hypothetical protein  35.58 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0900  PTS system, cellobiose-specific IIB component  38.95 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3049  PTS system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.18 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0704  PTS system, cellobiose-specific component IIB  34.29 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0038  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.67 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.58538  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1659  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  30.34 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0329869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.86 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0028  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.1 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1739  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  34.21 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1620  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  34.21 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0607362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1633  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  34.21 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.640995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1855  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.1 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2417  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  29.07 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0223  cellobiose-specific PTS system IIB component  31.88 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.981208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1208  cellobiose-specific PTS system IIB component  31.88 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.745209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2913  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  29.07 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.609986 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1257  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  41.38 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2290  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  28 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.4303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2479  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  28 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2253  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIB component  28 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2211  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIB component  28 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2462  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  28 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0685  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.05 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2269  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.91 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.316995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0200  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.63 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.572333  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2495  PTS system, cellobiose-specific IIB component, putative  28 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0465  cellobiose-specific PTS system IIB component  34.88 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00433056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2199  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIB component  36.99 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.709039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2558  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  28 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0008  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.62 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4224  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.1 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.211197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1789  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2493  PTS system, lactose/cellobiose-specific IIB component  35.62 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0332  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  28.36 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0009  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.62 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0533  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.78 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0264  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.25 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002435  PTS system cellobiose-specific IIB component  32.58 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3348  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  29.49 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2602  PTS system, IIB component  31.15 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3467  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.1 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1053  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.67 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1617  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  29.89 
 
 		 116 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2134  PTS system, lactose/cellobiose family IIB subunit  25.84 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2670  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.08 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3521  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  35.29 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0753  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  32.79 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0792  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  32.79 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0703  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.79 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0845  PTS system, cellobiose-specific IIB component  35.48 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0338  cellobiose-specific PTS system IIB component  33.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0701  PTS system, cellobiose-specific IIB component  35.48 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5305  PTS system, cellobiose-specific IIB component  27.78 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000478718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0834  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIB  31.17 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685625 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5449  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  27.78 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4896  PTS system, cellobiose-specific IIB subunit  27.78 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5064  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  27.78 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>