13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0941 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  28.7 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  32.5 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  29.92 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  32.61 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0204  hypothetical protein  29.46 
 
 		 121 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  30.43 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0218  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  29.77 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1553  hypothetical protein  28.47 
 
 		 161 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  30.37 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  31.75 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>