15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0965 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  273  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  40.68 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1975  hypothetical protein  34.07 
 
 
182 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0657  hypothetical protein  34.09 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0687  hypothetical protein  31.82 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  30.88 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3698  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  30.15 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  30.77 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  36.47 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  28.26 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.27 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>