14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3638 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  54.64 
 
 
170 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  54.05 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0657  hypothetical protein  52.46 
 
 
171 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0687  hypothetical protein  53.01 
 
 
175 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  72.44 
 
 
215 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  50.84 
 
 
167 aa  177  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3698  hypothetical protein  52.72 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  37.8 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  40.65 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  35.54 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1975  hypothetical protein  32.73 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  33.1 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  31.85 
 
 
134 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>