14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3914 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  69.66 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  68.75 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0657  hypothetical protein  69.29 
 
 		 171 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0687  hypothetical protein  68.57 
 
 		 175 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  71.31 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3698  hypothetical protein  68 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  59.29 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  39.02 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  33.59 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1975  hypothetical protein  36.15 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  32.23 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  28.26 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>