14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0502 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  59.43 
 
 		 170 aa  197  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0687  hypothetical protein  59.09 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0657  hypothetical protein  58.29 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  53.49 
 
 		 167 aa  177  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3698  hypothetical protein  58.29 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  71.2 
 
 		 215 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  64.46 
 
 		 182 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  41.8 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  32.03 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1975  hypothetical protein  36.2 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  42  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>