14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0728 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  61.08 
 
 		 170 aa  203  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0687  hypothetical protein  60.12 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0657  hypothetical protein  61.68 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  53.49 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3698  hypothetical protein  58.43 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  62.7 
 
 		 215 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  62.5 
 
 		 182 aa  154  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  40.83 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  33.08 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1975  hypothetical protein  35.66 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  35.54 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  30.43 
 
 		 160 aa  44.3  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>