17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0669 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0768  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.610234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0669  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2674  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.65 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1243  hypothetical protein  43.24 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00151809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.75 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.14 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  32.47 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  48.57 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1896  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.123017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1926  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 140 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>