60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0133 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0133  hypothetical protein  100 
 
 
708 aa  1443    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000995  hypothetical protein  47.92 
 
 
675 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534256  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07052  hypothetical protein  47.54 
 
 
672 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1102  putative exported ATPase protein  35.36 
 
 
717 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3526  ATPase  37 
 
 
684 aa  362  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00152782  hitchhiker  0.0000676723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2706  hypothetical protein  35.66 
 
 
749 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1341  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  33.23 
 
 
718 aa  300  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1061  hypothetical protein  33.43 
 
 
724 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2050  hypothetical protein  33.58 
 
 
712 aa  293  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.66244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1022  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  36.36 
 
 
722 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132056  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2958  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  33.95 
 
 
743 aa  282  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1387  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  36.31 
 
 
697 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3654  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  33.86 
 
 
713 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0920  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  32.42 
 
 
701 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.885186  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0211  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  26 
 
 
733 aa  233  7.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1367  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.01 
 
 
727 aa  219  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.704732  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0831  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  31.45 
 
 
790 aa  219  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0634  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.53 
 
 
795 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0461  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  32.95 
 
 
788 aa  213  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.340301  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1443  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  33.59 
 
 
788 aa  212  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0561507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0257  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  28.02 
 
 
726 aa  212  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3505  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  32.24 
 
 
670 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2621  hypothetical protein  31.42 
 
 
671 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2718  acetyltransferase  32.87 
 
 
672 aa  203  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.297323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2744  acetyltransferase  33.66 
 
 
672 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741032  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02328  hypothetical protein  31.03 
 
 
671 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02366  predicted hydrolase  31.03 
 
 
671 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1195  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  31.03 
 
 
671 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0952  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  25.04 
 
 
770 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2678  acetyltransferase  32.61 
 
 
672 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2970  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  29.08 
 
 
676 aa  201  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.379026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3696  hypothetical protein  30.2 
 
 
671 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2846  hypothetical protein  31.23 
 
 
671 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1143  hypothetical protein  30.7 
 
 
691 aa  200  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2605  hypothetical protein  30.39 
 
 
671 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1202  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.39 
 
 
671 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322003  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2754  hypothetical protein  30.39 
 
 
671 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2851  acetyltransferase  32.41 
 
 
672 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0450  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  34.09 
 
 
792 aa  197  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.17346  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0686  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  26.74 
 
 
801 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0246  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  25.73 
 
 
762 aa  195  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.588146  normal  0.529293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3175  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.1 
 
 
701 aa  193  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0536  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  33.4 
 
 
787 aa  192  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0565806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1368  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.4 
 
 
683 aa  191  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3138  acetyltransferase  30.4 
 
 
683 aa  190  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1252  acetyltransferase  30.4 
 
 
683 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2561  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  32.33 
 
 
651 aa  190  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750004 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0347  acetyltransferase  27.51 
 
 
650 aa  190  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241754  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0749  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.53 
 
 
753 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2980  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  29.6 
 
 
676 aa  180  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2620  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  29.48 
 
 
744 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.854532  normal  0.547734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2320  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.33 
 
 
792 aa  173  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56493  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1076  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  34.86 
 
 
675 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.671981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2532  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  31.26 
 
 
793 aa  170  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02807  hypothetical protein  27.77 
 
 
728 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38443  predicted protein  30.16 
 
 
986 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.856005  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46516  predicted protein  29.49 
 
 
1051 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01050  nucleolus protein, putative  24.84 
 
 
1069 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73970  Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase  24.52 
 
 
1044 aa  104  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962518  normal  0.0625315 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00247  nucleolar ATPase Kre33, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05310)  27.78 
 
 
1076 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>