60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1061 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1061  hypothetical protein  100 
 
 
724 aa  1496    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3526  ATPase  36.83 
 
 
684 aa  326  8.000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00152782  hitchhiker  0.0000676723 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07052  hypothetical protein  34.91 
 
 
672 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2706  hypothetical protein  37.07 
 
 
749 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1022  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  31.72 
 
 
722 aa  308  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132056  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0133  hypothetical protein  34.97 
 
 
708 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000995  hypothetical protein  32.67 
 
 
675 aa  299  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2958  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  30.59 
 
 
743 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1341  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  31.4 
 
 
718 aa  287  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1102  putative exported ATPase protein  31.94 
 
 
717 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1387  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  30.13 
 
 
697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3654  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  30.89 
 
 
713 aa  278  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2050  hypothetical protein  30.54 
 
 
712 aa  277  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.66244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0920  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.58 
 
 
701 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.885186  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0211  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.46 
 
 
733 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0686  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  28.9 
 
 
801 aa  213  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0749  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.36 
 
 
753 aa  209  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1443  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  29.87 
 
 
788 aa  208  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0561507 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2320  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.63 
 
 
792 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56493  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0831  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  28.65 
 
 
790 aa  206  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0461  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  28.32 
 
 
788 aa  203  8e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.340301  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1143  hypothetical protein  28.42 
 
 
691 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2561  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.72 
 
 
651 aa  203  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0450  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  33.18 
 
 
792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.17346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2620  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  31.34 
 
 
744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.854532  normal  0.547734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2532  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.22 
 
 
793 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0246  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  29.63 
 
 
762 aa  197  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.588146  normal  0.529293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3175  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.34 
 
 
701 aa  197  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3138  acetyltransferase  30.07 
 
 
683 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1368  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  29.02 
 
 
683 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1252  acetyltransferase  29.68 
 
 
683 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0952  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.69 
 
 
770 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1367  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.44 
 
 
727 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.704732  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0536  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  29.49 
 
 
787 aa  187  8e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0565806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1076  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.02 
 
 
675 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.671981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02807  hypothetical protein  29.95 
 
 
728 aa  184  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0634  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  25.84 
 
 
795 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3505  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.6 
 
 
670 aa  180  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2970  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  28.72 
 
 
676 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.379026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3696  hypothetical protein  30.56 
 
 
671 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2980  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.03 
 
 
676 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2718  acetyltransferase  27.66 
 
 
672 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.297323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2851  acetyltransferase  27.8 
 
 
672 aa  177  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02328  hypothetical protein  28.4 
 
 
671 aa  177  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02366  predicted hydrolase  28.4 
 
 
671 aa  177  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2678  acetyltransferase  27.69 
 
 
672 aa  177  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1195  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.4 
 
 
671 aa  177  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0347  acetyltransferase  28.23 
 
 
650 aa  176  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241754  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2744  acetyltransferase  29.13 
 
 
672 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741032  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2846  hypothetical protein  29.97 
 
 
671 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1202  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.38 
 
 
671 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322003  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2621  hypothetical protein  29.65 
 
 
671 aa  174  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0257  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  27.95 
 
 
726 aa  174  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2754  hypothetical protein  28.93 
 
 
671 aa  172  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2605  hypothetical protein  29.33 
 
 
671 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38443  predicted protein  26.17 
 
 
986 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.856005  normal  0.626674 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00247  nucleolar ATPase Kre33, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05310)  24.09 
 
 
1076 aa  97.8  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46516  predicted protein  26.01 
 
 
1051 aa  89.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01050  nucleolus protein, putative  21.72 
 
 
1069 aa  87  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73970  Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase  24.66 
 
 
1044 aa  78.2  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962518  normal  0.0625315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>