61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1143 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02366  predicted hydrolase  52.45 
 
 		 671 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1195  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  52.45 
 
 		 671 aa  638    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3175  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  82.45 
 
 		 701 aa  1142    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1143  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1391    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2980  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  59.35 
 
 		 676 aa  795    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02328  hypothetical protein  52.45 
 
 		 671 aa  638    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1076  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  58.85 
 
 		 675 aa  759    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.671981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3696  hypothetical protein  53.74 
 
 		 671 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1202  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  53.29 
 
 		 671 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1368  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  56.93 
 
 		 683 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3138  acetyltransferase  56.78 
 
 		 683 aa  742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3505  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  59.46 
 
 		 670 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1252  acetyltransferase  56.64 
 
 		 683 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2605  hypothetical protein  52.76 
 
 		 671 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2846  hypothetical protein  52.84 
 
 		 671 aa  628  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2621  hypothetical protein  52.69 
 
 		 671 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2754  hypothetical protein  52.61 
 
 		 671 aa  628  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2718  acetyltransferase  52.31 
 
 		 672 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.297323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2851  acetyltransferase  52.46 
 
 		 672 aa  612  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2678  acetyltransferase  52.01 
 
 		 672 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2744  acetyltransferase  51.86 
 
 		 672 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2970  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  51.81 
 
 		 676 aa  605  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.379026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0347  acetyltransferase  39.46 
 
 		 650 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2706  hypothetical protein  33.84 
 
 		 749 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3654  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  34.87 
 
 		 713 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1022  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  35.74 
 
 		 722 aa  256  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2958  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  36.91 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1341  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  31.6 
 
 		 718 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000995  hypothetical protein  31.53 
 
 		 675 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0920  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  32.29 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.885186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07052  hypothetical protein  33.1 
 
 		 672 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1387  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  34.78 
 
 		 697 aa  227  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3526  ATPase  30.61 
 
 		 684 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00152782  hitchhiker  0.0000676723 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2050  hypothetical protein  30.97 
 
 		 712 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.66244  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0133  hypothetical protein  33.7 
 
 		 708 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1061  hypothetical protein  28.42 
 
 		 724 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02807  hypothetical protein  26.96 
 
 		 728 aa  183  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1102  putative exported ATPase protein  33.86 
 
 		 717 aa  173  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2561  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  31.23 
 
 		 651 aa  168  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0686  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  25.75 
 
 		 801 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0749  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.03 
 
 		 753 aa  163  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0634  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  24.77 
 
 		 795 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0246  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  26 
 
 		 762 aa  160  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.588146  normal  0.529293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2532  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  26.67 
 
 		 793 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0257  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  27.29 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0211  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  23.26 
 
 		 733 aa  154  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2620  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.48 
 
 		 744 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.854532  normal  0.547734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0450  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  31.27 
 
 		 792 aa  143  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.17346  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2320  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.16 
 
 		 792 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0461  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  25.5 
 
 		 788 aa  140  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.340301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0831  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  26.67 
 
 		 790 aa  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1443  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  26.72 
 
 		 788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0561507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0952  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  26.65 
 
 		 770 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1367  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.24 
 
 		 727 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.704732  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0536  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.24 
 
 		 787 aa  125  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0565806 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38443  predicted protein  25.52 
 
 		 986 aa  92.8  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.856005  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73970  Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase  25.89 
 
 		 1044 aa  78.2  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962518  normal  0.0625315 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00247  nucleolar ATPase Kre33, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05310)  23.06 
 
 		 1076 aa  74.3  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01050  nucleolus protein, putative  23.54 
 
 		 1069 aa  74.3  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46516  predicted protein  26.02 
 
 		 1051 aa  60.5  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 		 301 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272339  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>