60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1341 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1341  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  100 
 
 
718 aa  1491    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2706  hypothetical protein  31.09 
 
 
749 aa  324  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3654  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  33.12 
 
 
713 aa  318  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2050  hypothetical protein  29.93 
 
 
712 aa  297  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.66244  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000995  hypothetical protein  30.03 
 
 
675 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1022  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  29.68 
 
 
722 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132056  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0133  hypothetical protein  33.23 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07052  hypothetical protein  29.07 
 
 
672 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1061  hypothetical protein  31.4 
 
 
724 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3526  ATPase  30.32 
 
 
684 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00152782  hitchhiker  0.0000676723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2958  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  31.5 
 
 
743 aa  264  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0920  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  29.73 
 
 
701 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.885186  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3138  acetyltransferase  31.56 
 
 
683 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1143  hypothetical protein  31.6 
 
 
691 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1368  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  29.37 
 
 
683 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1252  acetyltransferase  31.4 
 
 
683 aa  240  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3175  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  31.16 
 
 
701 aa  238  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1387  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  27.12 
 
 
697 aa  236  8e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2678  acetyltransferase  32.04 
 
 
672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2970  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  32.17 
 
 
676 aa  233  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.379026 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2851  acetyltransferase  32.04 
 
 
672 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2718  acetyltransferase  31.86 
 
 
672 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.297323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2744  acetyltransferase  31.49 
 
 
672 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741032  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3505  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.85 
 
 
670 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1076  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.86 
 
 
675 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.671981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02328  hypothetical protein  29.43 
 
 
671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1195  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  29.43 
 
 
671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02366  predicted hydrolase  29.43 
 
 
671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1102  putative exported ATPase protein  30.3 
 
 
717 aa  218  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2980  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.4 
 
 
676 aa  218  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2754  hypothetical protein  30.05 
 
 
671 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3696  hypothetical protein  30 
 
 
671 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02807  hypothetical protein  30.24 
 
 
728 aa  213  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1202  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  30.23 
 
 
671 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322003  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2846  hypothetical protein  29.64 
 
 
671 aa  212  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2605  hypothetical protein  29.88 
 
 
671 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2621  hypothetical protein  29.43 
 
 
671 aa  210  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0749  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  26.82 
 
 
753 aa  200  9e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0634  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  24.89 
 
 
795 aa  192  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0211  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  25.85 
 
 
733 aa  191  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0686  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  28.08 
 
 
801 aa  188  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0257  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  26.73 
 
 
726 aa  182  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2561  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  25.9 
 
 
651 aa  177  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750004 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1443  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  29.56 
 
 
788 aa  177  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0561507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0461  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  27.88 
 
 
788 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.340301  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2620  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.14 
 
 
744 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.854532  normal  0.547734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2320  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.96 
 
 
792 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56493  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0347  acetyltransferase  28.38 
 
 
650 aa  172  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241754  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0246  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  24.8 
 
 
762 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.588146  normal  0.529293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1367  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  25.77 
 
 
727 aa  169  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.704732  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0831  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  28.24 
 
 
790 aa  167  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0952  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  25 
 
 
770 aa  167  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0450  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  27.43 
 
 
792 aa  166  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.17346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2532  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  24.48 
 
 
793 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0536  protein of unknown function DUF699 ATPase putative  28.37 
 
 
787 aa  155  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0565806 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38443  predicted protein  23.64 
 
 
986 aa  120  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.856005  normal  0.626674 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73970  Predicted P-loop ATPase fused to an acetyltransferase  21.96 
 
 
1044 aa  110  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962518  normal  0.0625315 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01050  nucleolus protein, putative  21.8 
 
 
1069 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00247  nucleolar ATPase Kre33, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05310)  24.74 
 
 
1076 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46516  predicted protein  25 
 
 
1051 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>