21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1741 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1741  cobalt transport protein  100 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.645456  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0393  hypothetical protein  36 
 
 		 194 aa  62  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0623552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0211  hypothetical protein  37.86 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.136577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11100  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.87 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108743  normal  0.024314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.78 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0190  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.67 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000816865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.5 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1862  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.1 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.144825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  36.05 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.35 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.93 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  34.48 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.67 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1949  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  28.31 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.7 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.05 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.58 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2133  cobalt transport protein, putative  24.81 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.7 
 
 		 270 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>