13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1402 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1402  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1013    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0654  hypothetical protein  33.21 
 
 
701 aa  118  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1060  hypothetical protein  30.68 
 
 
702 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.655402  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0024  hypothetical protein  32.17 
 
 
693 aa  115  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0936  hypothetical protein  32.74 
 
 
690 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.900226  hitchhiker  0.00607638 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1075  hypothetical protein  29.11 
 
 
711 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.518834  normal  0.222972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0771  hypothetical protein  25.35 
 
 
875 aa  67.4  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0081  hypothetical protein  25.84 
 
 
663 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1013  hypothetical protein  27.04 
 
 
663 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.655102  decreased coverage  0.0000918159 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  22.66 
 
 
547 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  24.69 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2655  hypothetical protein  25 
 
 
517 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0177957  normal  0.130435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0942  S-layer-like domain-containing protein  19.61 
 
 
563 aa  43.9  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00793821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>