More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3613 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3613  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37990  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  80.63 
 
 
229 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0822078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5128  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  83.41 
 
 
224 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1625  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  82.51 
 
 
224 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4935  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  81.33 
 
 
224 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4552  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  81.33 
 
 
224 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4640  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  81.33 
 
 
224 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0847  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  78.57 
 
 
227 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10804  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  79.46 
 
 
224 aa  363  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.893292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6877  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  77.83 
 
 
223 aa  362  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5057  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  74.01 
 
 
231 aa  350  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4332  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  68.78 
 
 
222 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4766  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  70.59 
 
 
223 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4069  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  71.36 
 
 
225 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.31239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2954  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  67.25 
 
 
231 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8977  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.37 
 
 
227 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2075  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  67.26 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.476398  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3338  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  67.56 
 
 
226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05930  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  68.06 
 
 
222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0156  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  67.58 
 
 
235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0314  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  65.16 
 
 
230 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  65.33 
 
 
226 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3126  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  64.19 
 
 
237 aa  296  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5412  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  69.55 
 
 
231 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  66.67 
 
 
226 aa  296  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  61.4 
 
 
238 aa  287  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.492286  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  63.32 
 
 
238 aa  287  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0679  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  60.85 
 
 
261 aa  287  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4416  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  62.9 
 
 
237 aa  287  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0751085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  69.37 
 
 
239 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0541  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  60.43 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  62.01 
 
 
237 aa  279  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02510  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  60.67 
 
 
264 aa  277  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23390  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  58.75 
 
 
241 aa  277  9e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6406  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  62.16 
 
 
226 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0290  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  61.4 
 
 
228 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0407  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.81 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1055  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.57 
 
 
228 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0821  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.36 
 
 
223 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1030  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.59 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.176971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1421  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.69 
 
 
217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2306  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.43 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000119271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3506  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.69 
 
 
224 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.832851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1134  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.21 
 
 
228 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.44 
 
 
230 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294122  normal  0.0182898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.07 
 
 
227 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.07 
 
 
227 aa  225  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1523  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.88 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3954  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.96 
 
 
218 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1032  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.3 
 
 
225 aa  224  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2250  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.33 
 
 
227 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4981  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  224  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0425  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.94 
 
 
221 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0473378  normal  0.53438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1325  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.34 
 
 
231 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0293  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0325  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0268  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.61 
 
 
227 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0258  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.53 
 
 
228 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1625  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.13 
 
 
234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.93028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.68 
 
 
226 aa  221  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.618821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.6 
 
 
232 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3982  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.67 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1079  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.85 
 
 
223 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.67 
 
 
218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3904  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.67 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0995  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  58.33 
 
 
220 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.991641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0272  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.23 
 
 
227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0139  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.45 
 
 
226 aa  218  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000197765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.25 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.75 
 
 
221 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.970256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0819  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.73 
 
 
221 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.75 
 
 
222 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.7 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.45 
 
 
224 aa  215  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0537436  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.89 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal  0.0258582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.13 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.446689  normal  0.175392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.23 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372851  normal  0.0996971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.47 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1955  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  46.75 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1181  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.68 
 
 
231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.53 
 
 
235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.66 
 
 
233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0863769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0610  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.34 
 
 
226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.108966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0832  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.05 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.05 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0599  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50 
 
 
226 aa  211  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0215465  normal  0.0248858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0800  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.94 
 
 
217 aa  211  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1749  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.8 
 
 
233 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4091  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.66 
 
 
232 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.23 
 
 
223 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2482  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.13 
 
 
234 aa  210  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.02 
 
 
233 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2384  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.14 
 
 
223 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0336297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4136  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.26 
 
 
227 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4176  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  46.26 
 
 
227 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.46 
 
 
220 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>