More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1079 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1079  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  100 
 
 
223 aa  456  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  66.06 
 
 
221 aa  308  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.970256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1463  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  68.18 
 
 
222 aa  304  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.146312  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2962  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  65.02 
 
 
222 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2543  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  66.19 
 
 
222 aa  294  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0425  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  62.9 
 
 
221 aa  293  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0473378  normal  0.53438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1030  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  61.75 
 
 
220 aa  290  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.176971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2128  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  69.23 
 
 
222 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0275775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0803  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  69.23 
 
 
222 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  67.71 
 
 
222 aa  278  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1749  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.05 
 
 
233 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.05 
 
 
233 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0863769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1032  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.92 
 
 
225 aa  275  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4344  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.62 
 
 
233 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.083383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.45 
 
 
220 aa  272  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3716  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.76 
 
 
233 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106369  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1306  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.33 
 
 
233 aa  271  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.45 
 
 
223 aa  268  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0832  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.45 
 
 
223 aa  268  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2384  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.45 
 
 
223 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0336297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1635  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.9 
 
 
233 aa  267  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.67 
 
 
232 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0065  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  61.36 
 
 
222 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.393472  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0709  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.39 
 
 
230 aa  265  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0353041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5406  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.77 
 
 
233 aa  265  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.05 
 
 
223 aa  261  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203071  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.67 
 
 
224 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.67 
 
 
226 aa  258  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal  0.0258582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3954  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  60.73 
 
 
218 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0599  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.78 
 
 
226 aa  255  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0215465  normal  0.0248858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4981  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1181  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  58.19 
 
 
231 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0268  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3982  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.36 
 
 
218 aa  254  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0322  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0325  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0293  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.3 
 
 
227 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3904  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.36 
 
 
218 aa  254  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0610  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.78 
 
 
226 aa  254  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.108966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  59.36 
 
 
218 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.81 
 
 
223 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.84 
 
 
227 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1674  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.46 
 
 
228 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.62 
 
 
222 aa  252  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.6 
 
 
233 aa  251  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426219  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4091  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.17 
 
 
232 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.84 
 
 
227 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0421  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  57.89 
 
 
228 aa  250  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357294  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0272  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.84 
 
 
227 aa  250  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.91 
 
 
223 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372851  normal  0.0996971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.89 
 
 
226 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.553725  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.61 
 
 
222 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.446689  normal  0.175392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2306  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.35 
 
 
235 aa  248  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000119271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0258  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.96 
 
 
228 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2664  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.11 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  51.57 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.392911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0407  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  55.2 
 
 
224 aa  241  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  56.68 
 
 
226 aa  241  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1134  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.79 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0819  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.85 
 
 
221 aa  237  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.75 
 
 
226 aa  234  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.618821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1955  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  51.33 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3198  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  54.15 
 
 
230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2250  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.65 
 
 
227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296271 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09811  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.32 
 
 
218 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.119684 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0139  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.97 
 
 
226 aa  228  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000197765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2235  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50 
 
 
231 aa  228  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3506  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.75 
 
 
224 aa  228  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.832851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1523  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50 
 
 
235 aa  227  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50 
 
 
224 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0537436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5057  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.1 
 
 
231 aa  225  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6877  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.33 
 
 
223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1055  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.98 
 
 
228 aa  224  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37990  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  52.91 
 
 
229 aa  224  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0822078  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0461  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.83 
 
 
231 aa  224  8e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.88 
 
 
233 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4176  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.88 
 
 
227 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4136  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50.88 
 
 
227 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.25 
 
 
233 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0722  phosphoribosylformylglycinamidine synthase domain-containing protein  50.45 
 
 
222 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0187  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.31 
 
 
217 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4069  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.39 
 
 
225 aa  222  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.31239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0800  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50 
 
 
217 aa  222  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  50 
 
 
230 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294122  normal  0.0182898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.39 
 
 
217 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3613  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.85 
 
 
225 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2049  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.78 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.81616  normal  0.103111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0995  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit I  54.38 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.991641  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4416  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52.23 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0751085  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2755  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.7 
 
 
232 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000714476  hitchhiker  0.00646528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4332  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.67 
 
 
222 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10804  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  53.64 
 
 
224 aa  218  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.893292  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1655  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  48.9 
 
 
233 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.549373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.77 
 
 
223 aa  218  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1128  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  49.77 
 
 
223 aa  218  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.144919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2075  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  52 
 
 
225 aa  218  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.476398  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0489  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  47.11 
 
 
224 aa  217  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>