181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1883 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0461  hypothetical protein  76.8 
 
 
431 aa  710    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000121148  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0446  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  77.03 
 
 
431 aa  708    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1883  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
432 aa  885    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0977  quinolinate phosphoribosyl transferase  79.44 
 
 
431 aa  724    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1348  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  70.79 
 
 
436 aa  637    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5866  Quinolinate phosphoribosyl transferase  38.92 
 
 
360 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4519  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
372 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3350  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
380 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4584  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4939  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0436  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.976117  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4806  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4831  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4421  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4439  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0447412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4822  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.345122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4800  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2739  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
369 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1063  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 
454 aa  206  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06990  nicotinic acid phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
442 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1316  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  33.27 
 
 
455 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.370694  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1365  hypothetical protein  33.2 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1635  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  32.26 
 
 
455 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  decreased coverage  0.000680031 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2100  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
362 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.305575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0640  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
353 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.693214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0623  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 
365 aa  187  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl588  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
351 aa  177  3e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.245514  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf880  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 
335 aa  160  4e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1418  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 
333 aa  156  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1226  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
333 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1200  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 
333 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0274  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.465698  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0389  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
386 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1836  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0347625  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1356  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0507059 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1738  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.528808  hitchhiker  0.00323804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
386 aa  116  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.740861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2153  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0534946  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0859  quinolinate phosphoribosyl transferase  33.71 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2296  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
347 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00184248  hitchhiker  0.00000322818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1623  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 
388 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000252713  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1267  quinolinate phosphoribosyl transferase  30.36 
 
 
377 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.5366  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1529  Quinolinate phosphoribosyl transferase  28.23 
 
 
349 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000228999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0402  Quinolinate phosphoribosyl transferase  32.87 
 
 
385 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0053  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.62 
 
 
346 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1089  quinolinate phosphoribosyl transferase  25.31 
 
 
374 aa  97.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0123  Quinolinate phosphoribosyl transferase  30.18 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1328  Quinolinate phosphoribosyl transferase  30.34 
 
 
387 aa  94  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1313  Quinolinate phosphoribosyl transferase  26.49 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.052703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2201  Quinolinate phosphoribosyl transferase  31.49 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0766  quinolinate phosphoribosyl transferase  29.17 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0166376  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0977  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 
388 aa  87  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.908533  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0431  hypothetical protein  26.88 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.901098 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.96 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1203  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.12 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1983  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  27.88 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0260  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.012678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.67 
 
 
486 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0684  hypothetical protein  25.82 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.94 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.56 
 
 
460 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  25.36 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1116  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.78 
 
 
498 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.65 
 
 
462 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.99 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.54 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.71 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.71 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.9 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.38 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.46 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.91 
 
 
467 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 
489 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.26 
 
 
432 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.72 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.67 
 
 
489 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.84 
 
 
498 aa  64.3  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 
446 aa  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
433 aa  63.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>