78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1316 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1316  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
455 aa  934    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.370694  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1635  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  95.38 
 
 
455 aa  878    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  decreased coverage  0.000680031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1063  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.75 
 
 
454 aa  588  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1365  hypothetical protein  58.31 
 
 
449 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06990  nicotinic acid phosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5866  Quinolinate phosphoribosyl transferase  37.3 
 
 
360 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0446  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  34.68 
 
 
431 aa  225  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0977  quinolinate phosphoribosyl transferase  36.02 
 
 
431 aa  225  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0461  hypothetical protein  34.75 
 
 
431 aa  224  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000121148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1883  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  33.27 
 
 
432 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1348  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  32.8 
 
 
436 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4800  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4831  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4421  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4439  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0447412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4822  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.345122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4939  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4584  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0436  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
372 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.976117  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4806  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
372 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0623  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
365 aa  176  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4519  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
372 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3350  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
380 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2739  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 
369 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2100  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 
362 aa  160  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.305575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0640  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.693214  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl588  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.245514  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf880  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 
335 aa  117  6e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1226  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1418  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
333 aa  87  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1200  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.5 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0274  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.07 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.465698  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1623  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.23 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000252713  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2153  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0534946  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1738  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.528808  hitchhiker  0.00323804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0684  hypothetical protein  26.2 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2201  Quinolinate phosphoribosyl transferase  29.17 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0389  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.119776 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1328  Quinolinate phosphoribosyl transferase  23.56 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1983  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  28.48 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1203  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.63 
 
 
376 aa  63.2  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.740861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0260  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.012678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1089  quinolinate phosphoribosyl transferase  27.01 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0402  Quinolinate phosphoribosyl transferase  28.91 
 
 
385 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0123  Quinolinate phosphoribosyl transferase  27.63 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1267  quinolinate phosphoribosyl transferase  25.3 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.5366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3805  nicotinate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
491 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3722  nicotinate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
491 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1356  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0507059 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1529  Quinolinate phosphoribosyl transferase  29.62 
 
 
349 aa  59.7  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000228999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0977  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.87 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.908533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3664  nicotinate phosphoribosyltransferase related  24.72 
 
 
491 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.211664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0053  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
346 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2296  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.55 
 
 
347 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00184248  hitchhiker  0.00000322818 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0766  quinolinate phosphoribosyl transferase  27.53 
 
 
400 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0166376  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0859  quinolinate phosphoribosyl transferase  28.01 
 
 
413 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1836  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 
346 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0347625  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
451 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 
489 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1313  Quinolinate phosphoribosyl transferase  30.37 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.052703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  29.24 
 
 
491 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.94991 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  22.65 
 
 
488 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0100  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.94 
 
 
515 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00987122  normal  0.985664 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.24 
 
 
462 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.63 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
485 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.39 
 
 
495 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0431  hypothetical protein  25.32 
 
 
393 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.901098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  25.08 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.03 
 
 
477 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  22.55 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  21.68 
 
 
446 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.01 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0632  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.26 
 
 
505 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.037982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>