226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1200 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1418  nicotinate phosphoribosyltransferase  93.09 
 
 		 333 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1200  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 333 aa  681    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1226  nicotinate phosphoribosyltransferase  94.29 
 
 		 333 aa  649    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1836  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.17 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0347625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2296  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.18 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00184248  hitchhiker  0.00000322818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2153  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0534946  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1529  Quinolinate phosphoribosyl transferase  51.2 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000228999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0053  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.08 
 
 		 346 aa  315  6e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1738  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.39 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.528808  hitchhiker  0.00323804 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1313  Quinolinate phosphoribosyl transferase  41.59 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.052703  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0389  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.39 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 		 386 aa  215  7e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.740861 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.64 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1356  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.91 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0507059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0402  Quinolinate phosphoribosyl transferase  40.49 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1328  Quinolinate phosphoribosyl transferase  39.02 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0977  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.908533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0123  Quinolinate phosphoribosyl transferase  35.89 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0859  quinolinate phosphoribosyl transferase  41.07 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1089  quinolinate phosphoribosyl transferase  39.81 
 
 		 374 aa  202  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1623  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000252713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2201  Quinolinate phosphoribosyl transferase  39.21 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0766  quinolinate phosphoribosyl transferase  40.45 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0166376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 		 413 aa  194  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1267  quinolinate phosphoribosyl transferase  38.82 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.5366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0260  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.012678 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl588  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.32 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.245514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5866  Quinolinate phosphoribosyl transferase  37.57 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4831  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4421  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4439  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0447412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4822  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.345122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4584  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4939  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4800  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4806  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0436  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.976117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4519  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3350  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0640  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.693214  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2100  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.305575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0977  quinolinate phosphoribosyl transferase  31.59 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2739  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0461  hypothetical protein  30.14 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000121148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0623  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.72 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0446  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  30.14 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943428  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf880  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1883  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  30.49 
 
 		 432 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1348  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  29.78 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 		 451 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0274  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.465698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 		 489 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 450 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.79 
 
 		 463 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1063  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.61 
 
 		 454 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 		 460 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3220  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 		 458 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.62 
 
 		 462 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 491 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 		 478 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 		 452 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 		 476 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 		 453 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 465 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 485 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 		 489 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 		 489 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 468 aa  89.4  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 489 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0684  hypothetical protein  27.78 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 486 aa  87.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 468 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 		 488 aa  87  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 		 484 aa  85.9  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  27.57 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1203  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0318  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0293  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06990  nicotinic acid phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.914728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.73 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.73 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1116  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  31.03 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1365  hypothetical protein  25.98 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>