68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0684 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0684  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  842    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1203  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.95 
 
 		 376 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0431  hypothetical protein  66.58 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.901098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1983  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  66.02 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2100  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 		 362 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.305575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4806  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4584  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4939  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0640  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.99 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.693214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4831  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4421  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4439  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0447412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4800  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4822  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.345122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0623  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0436  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.2 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.976117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4519  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3350  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2739  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5866  Quinolinate phosphoribosyl transferase  29.84 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl588  nicotinate phosphoribosyltransferase  27 
 
 		 351 aa  96.7  7e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.245514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1200  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1226  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1418  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 		 333 aa  87  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2153  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0534946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0977  quinolinate phosphoribosyl transferase  28.22 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1529  Quinolinate phosphoribosyl transferase  28.93 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000228999  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf880  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.01 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0053  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1348  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  27.02 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2296  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00184248  hitchhiker  0.00000322818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0461  hypothetical protein  27.3 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000121148  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0446  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  26.99 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1883  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  25.82 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1836  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.94 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0347625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0274  nicotinate phosphoribosyltransferase  22.34 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.465698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1635  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  25.96 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  decreased coverage  0.000680031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0977  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.77 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.908533  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0766  quinolinate phosphoribosyl transferase  26.92 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0166376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1267  quinolinate phosphoribosyl transferase  26.74 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.5366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1316  nicotinic acid phosphoribosyltransferase-like protein  25 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.370694  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06990  nicotinic acid phosphoribosyltransferase  25.24 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0859  quinolinate phosphoribosyl transferase  26.07 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1063  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.92 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1328  Quinolinate phosphoribosyl transferase  27.76 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1365  hypothetical protein  25.16 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1089  quinolinate phosphoribosyl transferase  25.61 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2201  Quinolinate phosphoribosyl transferase  27.05 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1623  nicotinate phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000252713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1313  Quinolinate phosphoribosyl transferase  24.93 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.052703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.08 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  22.93 
 
 		 451 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.740861 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1356  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.76 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0507059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0402  Quinolinate phosphoribosyl transferase  24.38 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.16 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.16 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  25.9 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1738  nicotinate phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.528808  hitchhiker  0.00323804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  21.69 
 
 		 490 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  23.95 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  22.79 
 
 		 490 aa  43.5  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  22.3 
 
 		 486 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  21.25 
 
 		 488 aa  43.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  24.19 
 
 		 463 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>