56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3420 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0438  transposase  100 
 
 
139 aa  283  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0940  transposase  100 
 
 
139 aa  283  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3420  transposase  100 
 
 
139 aa  283  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0303169  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1852  transposase  100 
 
 
139 aa  283  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4226  transposase  100 
 
 
373 aa  283  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2402  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4780  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4475  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4293  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3761  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307691  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3606  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101133  normal  0.355095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3460  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3170  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2923  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648951  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2730  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1608  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4947  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1008  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0204  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.724095  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0200  transposase  100 
 
 
345 aa  282  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2784  transposase  100 
 
 
345 aa  282  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108617  decreased coverage  0.0022307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0020  transposase  99.28 
 
 
345 aa  280  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493218  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0289  transposase  100 
 
 
121 aa  246  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.986044  normal  0.397509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1100  transposase  36.84 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.196499  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1106  transposase  36.03 
 
 
165 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0278  transposase  37.93 
 
 
318 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1386  transposase  77.36 
 
 
58 aa  87.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2446  hypothetical protein  39.17 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.13841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  26.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  23.53 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  23.53 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  23.53 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  23.53 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  23.53 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  23.53 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  22.48 
 
 
345 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  22.48 
 
 
345 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  21.9 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  21.9 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  22.48 
 
 
345 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  22.14 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>