14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3403 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3403  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3752  hypothetical protein  57.64 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4028  hypothetical protein  57.64 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4233  hypothetical protein  47.46 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.727595 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7276  hypothetical protein  34.21 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4817  hypothetical protein  33.11 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9009  hypothetical protein  31.6 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2841  hypothetical protein  34.18 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4582  hypothetical protein  36.49 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4196  hypothetical protein  34.08 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.276849  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4799  hypothetical protein  34.48 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4549  hypothetical protein  31.43 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4575  hypothetical protein  30.33 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4510  hypothetical protein  30.43 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>