14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4233 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4233  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.727595 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3752  hypothetical protein  56.23 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4028  hypothetical protein  56.23 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3403  hypothetical protein  48.04 
 
 
294 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179634  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4549  hypothetical protein  39.94 
 
 
343 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4196  hypothetical protein  39.45 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.276849  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7276  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9009  hypothetical protein  36.76 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2841  hypothetical protein  39.02 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4575  hypothetical protein  38.29 
 
 
311 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4817  hypothetical protein  36.3 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4799  hypothetical protein  40.92 
 
 
316 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181071  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4582  hypothetical protein  38.83 
 
 
314 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4510  hypothetical protein  34.33 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>