15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4196 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4196  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.276849  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4549  hypothetical protein  61.21 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4575  hypothetical protein  64.15 
 
 
311 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7276  hypothetical protein  38.95 
 
 
317 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9009  hypothetical protein  38.14 
 
 
321 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148116  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4817  hypothetical protein  37.8 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4582  hypothetical protein  42.86 
 
 
314 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4233  hypothetical protein  41.78 
 
 
292 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.727595 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3752  hypothetical protein  39.39 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4028  hypothetical protein  39.39 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4799  hypothetical protein  40.68 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181071  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2841  hypothetical protein  34.74 
 
 
331 aa  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3403  hypothetical protein  33.02 
 
 
294 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179634  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4510  hypothetical protein  32.65 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4359  hypothetical protein  44.71 
 
 
89 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00335359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>