14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2841 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2841  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4582  hypothetical protein  41.87 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4233  hypothetical protein  37.98 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.727595 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7276  hypothetical protein  32.44 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9009  hypothetical protein  29.91 
 
 
321 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148116  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4817  hypothetical protein  31.8 
 
 
321 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3752  hypothetical protein  35.81 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4028  hypothetical protein  35.81 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4196  hypothetical protein  33.78 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.276849  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3403  hypothetical protein  34.49 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179634  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4575  hypothetical protein  35.53 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4549  hypothetical protein  33.45 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4799  hypothetical protein  35.84 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181071  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4510  hypothetical protein  27.37 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>