15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7276 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7276  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9009  hypothetical protein  76.66 
 
 		 321 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148116  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4817  hypothetical protein  77.29 
 
 		 321 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4799  hypothetical protein  46.69 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4196  hypothetical protein  36.63 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.276849  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4549  hypothetical protein  38.26 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4575  hypothetical protein  35.31 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4582  hypothetical protein  39.39 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3752  hypothetical protein  35.86 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4028  hypothetical protein  35.86 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2841  hypothetical protein  32.36 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4233  hypothetical protein  35.42 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.727595 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3403  hypothetical protein  32.24 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4359  hypothetical protein  58.82 
 
 		 89 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00335359  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4510  hypothetical protein  31.43 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>