15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4510 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4510  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4817  hypothetical protein  33.74 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9009  hypothetical protein  35.74 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148116  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7276  hypothetical protein  32.87 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4233  hypothetical protein  35.25 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.727595 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3752  hypothetical protein  31.99 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4028  hypothetical protein  31.99 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4575  hypothetical protein  35.53 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4196  hypothetical protein  33.22 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.276849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2841  hypothetical protein  28.15 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4582  hypothetical protein  33.22 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3403  hypothetical protein  29.73 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4799  hypothetical protein  34.03 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4549  hypothetical protein  31.23 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4359  hypothetical protein  50.94 
 
 		 89 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00335359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>