131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1863 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
165 aa  339  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3400  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.05 
 
 
158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3301  glyoxalase family protein  43.45 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3316  glyoxalase family protein  43.06 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3094  glyoxalase family protein  43.06 
 
 
152 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000115409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3339  glyoxalase family protein  43.06 
 
 
152 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3308  glyoxalase family protein  41.38 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.930237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2991  glyoxalase family protein  40.97 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3080  glyoxalase family protein  39.58 
 
 
152 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0373344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0799  glyoxalase family protein  38.58 
 
 
153 aa  88.2  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1508  fosfomycin resistance protein  37.4 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1720  glyoxalase family protein  37.4 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1499  fosfomycin/bleomycin resistance protein; lactoylglutathione lyase family protein  37.4 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1534  glyoxalase family protein  37.4 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.402633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1653  glyoxalase family protein  37.4 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.486994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1798  glyoxalase family protein  37.4 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1741  glyoxalase family protein  37.4 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.64 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.668931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2243  fosfomycin resistance protein  37.5 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000164785  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2999  fosfomycin resistance protein  37.5 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2546  fosfomycin resistance protein  34 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.658002  hitchhiker  0.00000000325933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2789  fosfomycin resistance protein  34.87 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000015113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2765  fosfomycin resistance protein  33.33 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000231179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2468  fosfomycin resistance protein  34.87 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.484363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2746  fosfomycin resistance protein  33.33 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.876802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  31.82 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  32.09 
 
 
238 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  32.58 
 
 
127 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
129 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  31.85 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  34.11 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  34.11 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  34.11 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  34.11 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  28.78 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
127 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  33.33 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  28.78 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2111  glyoxalase I  31.5 
 
 
122 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  30.37 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0396  lactoylglutathione lyase  34.29 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
128 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  31.01 
 
 
128 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  29.01 
 
 
128 aa  47.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  31.25 
 
 
129 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  31.25 
 
 
129 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  31.25 
 
 
129 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  27.91 
 
 
128 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  32.56 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  32.56 
 
 
135 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  32.37 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  31.54 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  29.63 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  31.25 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  27.69 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.12 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  31.78 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
131 aa  44.7  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  31.21 
 
 
136 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
146 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.76 
 
 
182 aa  44.3  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  33.59 
 
 
159 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  29.46 
 
 
135 aa  43.9  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  31.82 
 
 
128 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  31.65 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  29.32 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0859  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.848373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  29.92 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  27.82 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  28.68 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  28.89 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  36.67 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 
144 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  32.35 
 
 
138 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  31.82 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  26.92 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  32.35 
 
 
138 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>