20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0803 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0803  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  100 
 
 		 349 aa  709    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.558654  hitchhiker  0.0000350456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3238  hypothetical protein  43.29 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2192  hypothetical protein  36.06 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2792  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  36.71 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.805909  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2406  hypothetical protein  33.89 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.975595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3378  SPP1 family phage head morphogenesis protein  30.19 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3417  SPP1 family phage head morphogenesis protein  29.64 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.53739e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0540  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  34.35 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2476  SPP1 family phage head morphogenesis protein  35.44 
 
 		 469 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0919  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  27.14 
 
 		 1529 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3803  SPP1 family phage head morphogenesis protein  27.14 
 
 		 1529 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1907  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  27.14 
 
 		 1524 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1428  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  26.49 
 
 		 641 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2969  SPP1 family phage head morphogenesis protein  32.99 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2104  NAD+--asparagine ADP-ribosyltransferase  32.89 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2987  SPP1 family phage head morphogenesis protein  39.24 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  43.9 
 
 		 728 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0879  hypothetical protein  24.62 
 
 		 448 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1364  SPP1 family phage head morphogenesis protein  26.89 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  42.86 
 
 		 729 aa  42.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>