29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2476 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2476  SPP1 family phage head morphogenesis protein  100 
 
 		 469 aa  970    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2969  SPP1 family phage head morphogenesis protein  31.24 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1428  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  36.84 
 
 		 641 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2104  NAD+--asparagine ADP-ribosyltransferase  27.68 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0607  Phage Mu protein F like protein  31.3 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0669  Phage Mu protein F like protein  31.3 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000892912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2945  SPP1 family phage head morphogenesis protein  30.75 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2987  SPP1 family phage head morphogenesis protein  38.84 
 
 		 220 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0907  SPP1 family phage head morphogenesis protein  28.57 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0889  SPP1 family phage head morphogenesis protein  28.57 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0879  hypothetical protein  24.78 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1776  Phage Mu protein F like protein  26.13 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1135  Phage Mu protein F like protein  26.73 
 
 		 347 aa  83.2  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0952  putative phage minor capsid protein  48.65 
 
 		 545 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.217615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2792  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  30.83 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.805909  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2406  hypothetical protein  32.5 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.975595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0803  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  35.44 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.558654  hitchhiker  0.0000350456 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0919  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  24.48 
 
 		 1529 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3417  SPP1 family phage head morphogenesis protein  23.83 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.53739e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0644  hypothetical protein  31.46 
 
 		 263 aa  47.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.751341  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0671  hypothetical protein  31.46 
 
 		 260 aa  47.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.083936  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3085  Phage Mu-F related protein  28.36 
 
 		 182 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4230  hypothetical protein  28.73 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0262435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0835  SPP1 family phage head morphogenesis protein  23.81 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3803  SPP1 family phage head morphogenesis protein  23.88 
 
 		 1529 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0353  SPP1 family phage head morphogenesis protein  23.56 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0344  SPP1 family phage head morphogenesis protein  23.56 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3378  SPP1 family phage head morphogenesis protein  24.66 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1907  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  23.88 
 
 		 1524 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>