More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0300 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0300  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
476 aa  960    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0337963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  52.81 
 
 
482 aa  486  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
493 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  47.3 
 
 
493 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  37.61 
 
 
497 aa  306  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3363  Leucyl aminopeptidase  47.66 
 
 
471 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  37.55 
 
 
487 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  38.54 
 
 
493 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  38.41 
 
 
488 aa  299  8e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.15 
 
 
497 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  39.15 
 
 
497 aa  297  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  40.33 
 
 
500 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.62 
 
 
482 aa  294  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2878  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
497 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  38.44 
 
 
497 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  44.41 
 
 
495 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  36.94 
 
 
491 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  40.81 
 
 
496 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3532  leucyl aminopeptidase  37.37 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 
512 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  40.94 
 
 
503 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 
503 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  36.19 
 
 
502 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 
503 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  36.9 
 
 
495 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  39.49 
 
 
503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  38.86 
 
 
498 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4743  leucyl aminopeptidase  37.79 
 
 
494 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  39.21 
 
 
496 aa  286  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5060  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 
494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  36.92 
 
 
495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  36.88 
 
 
492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  36.84 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3023  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 
502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  39.3 
 
 
511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  38.77 
 
 
496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  39.02 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  43.87 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  43.48 
 
 
499 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  36.97 
 
 
497 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  39.02 
 
 
503 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4792  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
494 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5155  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
494 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5032  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
494 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4633  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
494 aa  281  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4653  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
494 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0181  leucyl aminopeptidase  37.85 
 
 
494 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2018  leucyl aminopeptidase  40.39 
 
 
490 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  39.74 
 
 
498 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  36.06 
 
 
496 aa  280  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 
500 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5057  leucyl aminopeptidase  37.85 
 
 
494 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.708172  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13861  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 
493 aa  279  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0993846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  37.02 
 
 
496 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  38.11 
 
 
496 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
500 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2727  leucyl aminopeptidase  39.09 
 
 
491 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0069  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 
496 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  36.34 
 
 
497 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
504 aa  277  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5066  leucyl aminopeptidase  37.42 
 
 
494 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  42.81 
 
 
499 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  35.73 
 
 
518 aa  276  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  35.67 
 
 
518 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  36.34 
 
 
497 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  36.62 
 
 
500 aa  276  8e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3910  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
491 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.723186  normal  0.561505 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  37.61 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  37.85 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  39.49 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  37.56 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  37.78 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  42.16 
 
 
488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  36.13 
 
 
497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  35.5 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  43.35 
 
 
500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3861  leucyl aminopeptidase  39.34 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
503 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  39.06 
 
 
497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  38.77 
 
 
497 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 
502 aa  273  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  37.79 
 
 
499 aa  272  1e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
502 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
502 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  38.57 
 
 
497 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 
502 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
502 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 
493 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  40.75 
 
 
539 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  36.48 
 
 
498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  39.12 
 
 
495 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>