45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11982 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11982  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  49.32 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  46.58 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  45.21 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  49.35 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  43.06 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  41.67 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  41.67 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  45.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  48.05 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  48.05 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  48.05 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  49.33 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  46.67 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  42.47 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  43.24 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  42.19 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  38.89 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  37.5 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  38.67 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  39.19 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  38.36 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  36.76 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  38.81 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  34.92 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  50 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  32.31 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  35.06 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  29.17 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  41.1 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  41.46 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  48 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  36.51 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  42.65 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  39.58 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>