25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2357 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2357  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  984    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1578  hypothetical protein  45.9 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0579  hypothetical protein  44.87 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2925  hypothetical protein  45.52 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.665125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3194  hypothetical protein  45.52 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1741  hypothetical protein  41.65 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.230988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2449  hypothetical protein  39.26 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000077314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  29.19 
 
 		 906 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1099 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  26.21 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  29.3 
 
 		 906 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  29.3 
 
 		 906 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  26.11 
 
 		 911 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  26.54 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  24.86 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  27.5 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  22.67 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  28.67 
 
 		 380 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  27.56 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  27.56 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  27.56 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>