13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1741 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1741  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1060    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.230988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1578  hypothetical protein  53.21 
 
 
497 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0579  hypothetical protein  48.74 
 
 
501 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3194  hypothetical protein  48.22 
 
 
495 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2925  hypothetical protein  48.22 
 
 
495 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.665125  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2357  hypothetical protein  41.65 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2449  hypothetical protein  43.79 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000077314 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  26.11 
 
 
515 aa  60.5  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  27.97 
 
 
906 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.4 
 
 
303 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  28.66 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  26.2 
 
 
806 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6482  virulence protein SrfB  22.77 
 
 
1048 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>