16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3194 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3194  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1023    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1578  hypothetical protein  65.01 
 
 
497 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2925  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1023    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.665125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0579  hypothetical protein  51.76 
 
 
501 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1741  hypothetical protein  48.22 
 
 
508 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.230988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2449  hypothetical protein  47.61 
 
 
528 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000077314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2357  hypothetical protein  45.52 
 
 
481 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  28.17 
 
 
515 aa  60.8  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  26.47 
 
 
906 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  30.49 
 
 
911 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  27.88 
 
 
906 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  27.61 
 
 
906 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  25.64 
 
 
439 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  25.64 
 
 
439 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  25.64 
 
 
439 aa  43.5  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  25.64 
 
 
439 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>