22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2269 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2269  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3420  hypothetical protein  47.3 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2679  hypothetical protein  45.08 
 
 
269 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0917  hypothetical protein  47.41 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.285275  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0891  hypothetical protein  47.41 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3065  hypothetical protein  46.44 
 
 
257 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1556  hypothetical protein  50.72 
 
 
219 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.982843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0341  hypothetical protein  50.62 
 
 
244 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1770  hypothetical protein  34.21 
 
 
228 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04931  hypothetical protein  33.77 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.503392  normal  0.44137 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0437  hypothetical protein  38.76 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05001  hypothetical protein  35.92 
 
 
216 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04621  hypothetical protein  37.56 
 
 
212 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04931  hypothetical protein  37.09 
 
 
212 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06321  hypothetical protein  41.58 
 
 
226 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.144634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1763  hypothetical protein  41.46 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0599  hypothetical protein  39.23 
 
 
217 aa  92  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.30263  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04351  hypothetical protein  36.19 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2974  hypothetical protein  24.65 
 
 
331 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.324632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2652  hypothetical protein  24.65 
 
 
331 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0372503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  30.84 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  44.44 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>