27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2652 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2652  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0372503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2974  hypothetical protein  96.98 
 
 		 331 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.324632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5598  hypothetical protein  23.33 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0121359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  24.84 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2912  membrane protein-like protein  24.85 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5622  hypothetical protein  23.62 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  22.67 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137644  hitchhiker  0.000000122299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5659  hypothetical protein  23.93 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5152  hypothetical protein  23.69 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000091778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  27.4 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  23.55 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5168  hypothetical protein  23.69 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5581  hypothetical protein  23.62 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.747160000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5324  hypothetical protein  23.19 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5720  hypothetical protein  23.19 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000676136  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3420  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0131  membrane protein-like  23.08 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0867832  normal  0.324559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2269  hypothetical protein  24.65 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1556  hypothetical protein  25.78 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.982843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0341  hypothetical protein  24.11 
 
 		 244 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  24.46 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2679  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0891  hypothetical protein  25.53 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0917  hypothetical protein  25.53 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.285275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  25.11 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  21 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3065  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>