22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1107 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1107  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  327  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.217641 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0840  hypothetical protein  90.62 
 
 
160 aa  307  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.532109  normal  0.0632137 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13121  hypothetical protein  91.25 
 
 
160 aa  305  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2105  hypothetical protein  79.38 
 
 
160 aa  266  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.310588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4560  hypothetical protein  78.12 
 
 
160 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.909348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3479  hypothetical protein  79.38 
 
 
160 aa  262  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.854167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1407  hypothetical protein  76.88 
 
 
160 aa  261  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41965  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2716  hypothetical protein  76.25 
 
 
160 aa  261  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5392  hypothetical protein  74.38 
 
 
160 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.692914  normal  0.894504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4752  hypothetical protein  77.5 
 
 
160 aa  256  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0139717  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2618  hypothetical protein  75 
 
 
160 aa  255  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7575  hypothetical protein  73.75 
 
 
160 aa  254  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.690895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0055  hypothetical protein  73.75 
 
 
160 aa  254  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899149  normal  0.0738281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0244  hypothetical protein  73.75 
 
 
160 aa  253  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1991  hypothetical protein  79.38 
 
 
160 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0562  hypothetical protein  80 
 
 
160 aa  250  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6660  hypothetical protein  41.61 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00729758  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2061  hypothetical protein  43.26 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4694  hypothetical protein  43.26 
 
 
174 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1225  hypothetical protein  43.26 
 
 
173 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.551867  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2151  hypothetical protein  27.21 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150787  normal  0.442315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1975  hypothetical protein  28.12 
 
 
122 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>