20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0562 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3479  hypothetical protein  90 
 
 		 160 aa  298  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.854167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2105  hypothetical protein  89.38 
 
 		 160 aa  296  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.310588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1407  hypothetical protein  82.5 
 
 		 160 aa  279  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41965  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2716  hypothetical protein  81.88 
 
 		 160 aa  279  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4560  hypothetical protein  83.12 
 
 		 160 aa  278  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.909348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0840  hypothetical protein  80 
 
 		 160 aa  270  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.532109  normal  0.0632137 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5392  hypothetical protein  79.38 
 
 		 160 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.692914  normal  0.894504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0055  hypothetical protein  79.38 
 
 		 160 aa  268  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899149  normal  0.0738281 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7575  hypothetical protein  78.75 
 
 		 160 aa  268  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.690895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0244  hypothetical protein  79.38 
 
 		 160 aa  267  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1107  hypothetical protein  80 
 
 		 160 aa  267  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.217641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4752  hypothetical protein  80 
 
 		 160 aa  267  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0139717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13121  hypothetical protein  80 
 
 		 160 aa  266  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2618  hypothetical protein  81.88 
 
 		 160 aa  266  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1991  hypothetical protein  78.75 
 
 		 160 aa  245  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2061  hypothetical protein  47.52 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1225  hypothetical protein  48.23 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.551867  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6660  hypothetical protein  48.23 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00729758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4694  hypothetical protein  46.1 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>