15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1975 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1975  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2151  hypothetical protein  90.98 
 
 
139 aa  231  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150787  normal  0.442315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2153  hypothetical protein  86.89 
 
 
122 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0840  hypothetical protein  29.69 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.532109  normal  0.0632137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  36.25 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1107  hypothetical protein  28.12 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.217641 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7575  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.690895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2618  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13121  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  25.93 
 
 
114 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  24.75 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  32.69 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>