15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0988 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0988  inorganic carbon transport protein  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0894  inorganic carbon transport protein  69.88 
 
 		 83 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604143  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18141  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  75 
 
 		 68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0006  hypothetical protein  59.3 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.136578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06251  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  55.68 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0570  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  59.15 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06351  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  52.63 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05961  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  55.26 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06261  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  59.15 
 
 		 77 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4747  NADH dehydrogenase subunit  44.78 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2080  inorganic carbon transport  45.16 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0200444  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4495  inorganic carbon transport  41.79 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3162  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1488  NADH dehydrogenase subunit  43.42 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1516  hypothetical protein  43.42 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>