15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06261 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_06261  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  100 
 
 
77 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05961  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  94.81 
 
 
77 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0570  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  89.61 
 
 
77 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06351  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  75.32 
 
 
77 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06251  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  66.2 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0006  hypothetical protein  70.59 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.136578  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18141  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  66.67 
 
 
68 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0894  inorganic carbon transport protein  57.75 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604143  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0988  inorganic carbon transport protein  59.15 
 
 
83 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2080  inorganic carbon transport  48.21 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0200444  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4747  NADH dehydrogenase subunit  41.79 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1488  NADH dehydrogenase subunit  44.78 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1516  hypothetical protein  44.78 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324231  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3162  hypothetical protein  43.1 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4495  inorganic carbon transport  35.71 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>