15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0570 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0570  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  100 
 
 
77 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06261  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  89.61 
 
 
77 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05961  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  88.31 
 
 
77 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06351  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  76.62 
 
 
77 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0006  hypothetical protein  70.59 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.136578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06251  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  64.79 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18141  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  66.67 
 
 
68 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0988  inorganic carbon transport protein  59.15 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0894  inorganic carbon transport protein  54.93 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2080  inorganic carbon transport  50 
 
 
70 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0200444  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4747  NADH dehydrogenase subunit  40.3 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1488  NADH dehydrogenase subunit  43.28 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1516  hypothetical protein  43.28 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324231  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4495  inorganic carbon transport  37.14 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921559  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3162  hypothetical protein  44.64 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>