15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06351 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_06351  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  100 
 
 
77 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05961  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  79.22 
 
 
77 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0570  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  76.62 
 
 
77 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06261  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  75.32 
 
 
77 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06251  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  67.61 
 
 
89 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0006  hypothetical protein  69.57 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.136578  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0988  inorganic carbon transport protein  52.63 
 
 
83 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18141  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  62.69 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0894  inorganic carbon transport protein  50 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2080  inorganic carbon transport  45.9 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0200444  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4747  NADH dehydrogenase subunit  38.46 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4495  inorganic carbon transport  38.03 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921559  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1488  NADH dehydrogenase subunit  40 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1516  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324231  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3162  hypothetical protein  46.43 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>