13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0894 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0894  inorganic carbon transport protein  100 
 
 		 83 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604143  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0988  inorganic carbon transport protein  69.88 
 
 		 83 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18141  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  68.66 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06261  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  57.75 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05961  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  56.34 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0570  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  54.93 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06351  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  50 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06251  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  57.14 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0006  hypothetical protein  57.35 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.136578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2080  inorganic carbon transport  51.61 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0200444  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4747  NADH dehydrogenase subunit  43.28 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4495  inorganic carbon transport  43.48 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3162  hypothetical protein  50.79 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>