15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0006 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0006  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.136578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06251  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  95.51 
 
 
89 aa  166  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0988  inorganic carbon transport protein  59.3 
 
 
83 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06351  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  69.57 
 
 
77 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18141  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  69.23 
 
 
68 aa  96.7  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05961  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  70.59 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0570  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  70.59 
 
 
77 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06261  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  70.59 
 
 
77 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0894  inorganic carbon transport protein  57.35 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2080  inorganic carbon transport  49.18 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0200444  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4747  NADH dehydrogenase subunit  38.36 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4495  inorganic carbon transport  44.78 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921559  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3162  hypothetical protein  49.18 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1488  NADH dehydrogenase subunit  42.62 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1516  hypothetical protein  42.62 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>