17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1488 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1488  NADH dehydrogenase subunit  100 
 
 		 81 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4747  NADH dehydrogenase subunit  76.62 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2080  inorganic carbon transport  55.71 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0200444  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3162  hypothetical protein  64.79 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4495  inorganic carbon transport  55.84 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0570  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  43.28 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0903127  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0988  inorganic carbon transport protein  43.42 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06261  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  44.78 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05961  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  43.28 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4940  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L  64.71 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06251  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  37.68 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06351  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  37.68 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.852768  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0006  hypothetical protein  37.68 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.136578  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18141  NADH dehydrogenase subunit NdhL (ndhL)  42.62 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0894  inorganic carbon transport protein  40.3 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604143  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0413  hypothetical protein  64.81 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>