42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_R0093 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_R0093  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0078  tRNA-Pro  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000180331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0089  tRNA-Pro  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4561  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0035  tRNA-Pro  86.79 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14020  tRNA-Pro  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0043  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0027  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0029  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0677736  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23920  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106953  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0029  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.396369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15160  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06390  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284201  normal  0.0452079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0024  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0559967  normal  0.0473979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0003  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.769558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0011  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0067  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0043  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14021  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0053  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>