23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_R0089 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_R0078  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000180331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0089  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0093  tRNA-Pro  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0055  tRNA-Pro  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0030  tRNA-Phe  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0432056  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15160  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06390  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284201  normal  0.0452079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0024  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0559967  normal  0.0473979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0020  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>